Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtskP55097 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtskP55097 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtskP55097 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtskP55097 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtskP55097 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtskP55097 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtskP55097 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtskP55097 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtskP55097 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtskP55097 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtskP55097 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtskP55097 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtskP55097 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtskP55097 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CtskP55097 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtskP55097 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtskP55097 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtskP55097 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtskP55097 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtskP55097 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtskP55097 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtskP55097 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtskP55097 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtskP55097 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtskP55097 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtskP55097 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtskP55097 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtskP55097 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtskP55097 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtskP55097 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms