Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NrlP54846 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NrlP54846 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NrlP54846 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NrlP54846 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NrlP54846 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NrlP54846 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NrlP54846 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NrlP54846 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NrlP54846 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NrlP54846 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NrlP54846 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NrlP54846 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NrlP54846 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NrlP54846 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NrlP54846 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrlP54846 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrlP54846 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrlP54846 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrlP54846 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrlP54846 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrlP54846 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrlP54846 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrlP54846 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrlP54846 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrlP54846 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrlP54846 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrlP54846 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrlP54846 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrlP54846 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NrlP54846 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrlP54846 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrlP54846 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrlP54846 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrlP54846 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NrlP54846 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NrlP54846 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms