Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms