Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Faf1P54731 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms