Protein–RNA interactions for Protein: P53986

Slc16a1, Monocarboxylate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a1P53986 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc16a1P53986 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc16a1P53986 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms