Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fdft1P53798 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms