Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
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