Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Dbx1P52950 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Dbx1P52950 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Dbx1P52950 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Dbx1P52950 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Dbx1P52950 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Dbx1P52950 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Dbx1P52950 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Dbx1P52950 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Dbx1P52950 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Dbx1P52950 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Dbx1P52950 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Dbx1P52950 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dbx1P52950 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms