Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fgd1P52734 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms