Protein–RNA interactions for Protein: P51943

Ccna2, Cyclin-A2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna2P51943 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccna2P51943 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccna2P51943 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccna2P51943 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccna2P51943 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccna2P51943 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccna2P51943 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccna2P51943 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccna2P51943 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccna2P51943 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccna2P51943 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccna2P51943 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccna2P51943 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccna2P51943 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccna2P51943 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccna2P51943 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccna2P51943 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccna2P51943 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccna2P51943 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccna2P51943 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccna2P51943 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccna2P51943 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccna2P51943 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms