Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfP51642 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfP51642 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfP51642 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfP51642 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfP51642 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfP51642 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfP51642 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CntfP51642 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CntfP51642 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CntfP51642 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfP51642 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CntfP51642 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CntfP51642 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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CntfP51642 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CntfP51642 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CntfP51642 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CntfP51642 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfP51642 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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