Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa-rs12P50716 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms