Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cav1P49817 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cav1P49817 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms