Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb42P49222 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb42P49222 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb42P49222 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms