Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rbp3P49194 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms