Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CitP49025 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CitP49025 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CitP49025 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CitP49025 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms