Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms