Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms