Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TgfaP48030 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TgfaP48030 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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