Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CratP47934 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CratP47934 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CratP47934 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms