Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gli1P47806 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gli1P47806 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gli1P47806 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gli1P47806 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms