Protein–RNA interactions for Protein: P46978

Stt3a, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3aP46978 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms