Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf1P46099 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms