Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt1P46096 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms