Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms