Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbP41155 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbP41155 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LtbP41155 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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