Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd1P40201 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd1P40201 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd1P40201 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd1P40201 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd1P40201 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd1P40201 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd1P40201 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd1P40201 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd1P40201 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chd1P40201 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms