Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fen1P39749 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fen1P39749 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms