Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lig1P37913 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig1P37913 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lig1P37913 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms