Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprkP35822 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprkP35822 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprkP35822 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprkP35822 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprkP35822 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprkP35822 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtprkP35822 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprkP35822 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprkP35822 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprkP35822 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprkP35822 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprkP35822 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprkP35822 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtprkP35822 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms