Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rfc1P35601 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfc1P35601 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms