Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab20P35295 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab20P35295 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab20P35295 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms