Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab23P35288 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab23P35288 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms