Protein–RNA interactions for Protein: P34968

Htr2c, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr2cP34968 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr2cP34968 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr2cP34968 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms