Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Notch4P31695 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Notch4P31695 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Notch4P31695 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Notch4P31695 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms