Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxraP28700 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxraP28700 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxraP28700 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxraP28700 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxraP28700 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxraP28700 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxraP28700 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxraP28700 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxraP28700 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxraP28700 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxraP28700 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxraP28700 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxraP28700 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxraP28700 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxraP28700 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RxraP28700 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxraP28700 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxraP28700 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxraP28700 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxraP28700 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxraP28700 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxraP28700 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxraP28700 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RxraP28700 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RxraP28700 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxraP28700 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxraP28700 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxraP28700 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxraP28700 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxraP28700 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxraP28700 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxraP28700 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxraP28700 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxraP28700 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RxraP28700 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxraP28700 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxraP28700 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxraP28700 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxraP28700 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxraP28700 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxraP28700 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxraP28700 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxraP28700 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxraP28700 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RxraP28700 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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