Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dusp1P28563 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dusp1P28563 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms