Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Hoxd10P28359 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Hoxd10P28359 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Hoxd10P28359 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Hoxd10P28359 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd10P28359 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms