Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms