Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa5P28312 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa5P28312 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms