Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6aP27664 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms