Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rpl3P27659 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl3P27659 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl3P27659 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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