Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CftrP26361 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CftrP26361 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CftrP26361 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CftrP26361 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CftrP26361 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CftrP26361 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CftrP26361 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CftrP26361 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CftrP26361 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CftrP26361 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CftrP26361 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CftrP26361 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CftrP26361 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CftrP26361 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CftrP26361 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CftrP26361 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CftrP26361 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CftrP26361 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CftrP26361 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CftrP26361 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CftrP26361 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CftrP26361 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CftrP26361 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CftrP26361 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CftrP26361 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CftrP26361 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CftrP26361 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CftrP26361 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CftrP26361 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CftrP26361 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CftrP26361 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CftrP26361 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CftrP26361 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CftrP26361 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CftrP26361 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CftrP26361 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CftrP26361 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CftrP26361 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CftrP26361 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CftrP26361 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CftrP26361 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CftrP26361 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CftrP26361 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CftrP26361 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CftrP26361 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CftrP26361 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CftrP26361 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CftrP26361 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CftrP26361 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CftrP26361 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CftrP26361 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CftrP26361 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CftrP26361 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CftrP26361 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CftrP26361 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CftrP26361 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CftrP26361 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CftrP26361 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CftrP26361 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CftrP26361 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CftrP26361 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CftrP26361 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CftrP26361 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CftrP26361 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CftrP26361 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CftrP26361 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CftrP26361 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CftrP26361 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CftrP26361 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CftrP26361 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CftrP26361 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CftrP26361 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CftrP26361 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CftrP26361 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CftrP26361 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CftrP26361 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CftrP26361 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CftrP26361 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CftrP26361 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CftrP26361 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CftrP26361 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CftrP26361 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CftrP26361 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CftrP26361 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CftrP26361 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CftrP26361 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CftrP26361 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CftrP26361 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CftrP26361 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CftrP26361 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CftrP26361 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CftrP26361 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CftrP26361 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CftrP26361 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CftrP26361 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CftrP26361 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CftrP26361 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CftrP26361 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CftrP26361 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms