Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ctnna1P26231 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnna1P26231 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms