Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfkb1P25799 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms