Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd1P25322 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms