Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gria1P23818 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms