Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3aP23116 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms