Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clk1P22518 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk1P22518 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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