Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BdnfP21237 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BdnfP21237 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BdnfP21237 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BdnfP21237 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BdnfP21237 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BdnfP21237 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BdnfP21237 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BdnfP21237 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BdnfP21237 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BdnfP21237 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BdnfP21237 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BdnfP21237 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BdnfP21237 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BdnfP21237 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BdnfP21237 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BdnfP21237 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BdnfP21237 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BdnfP21237 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BdnfP21237 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BdnfP21237 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BdnfP21237 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BdnfP21237 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BdnfP21237 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BdnfP21237 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BdnfP21237 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BdnfP21237 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
BdnfP21237 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BdnfP21237 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BdnfP21237 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BdnfP21237 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BdnfP21237 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BdnfP21237 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BdnfP21237 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BdnfP21237 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BdnfP21237 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BdnfP21237 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BdnfP21237 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms